Существует несколько способов сохранить анимацию. Наиболее очевидным способом является создание GIF-файла, однако при этом следует учитывать возможности его оптимизации. Кроме того, анимацию можно сохранить в виде исполняемого файла, для которого не требуется программы-проигрывателя, а также в одном из форматов видео. Чтобы сохранить анимацию в формате GIF-файла, следует выбрать команду File > Save (Файл > Сохранить), если файл сохранялся ранее, или File > Save As (Файл > Сохранить как), по которой открывается диалоговое окно Save As (Сохранить как). В этом случае файлу можно присвоить новое имя. Если же требуется сократить размер файла, то используют команду File > Optimization Wizard (Файл > Мастер оптимизации), запускающую Мастер оптимизации.
GIF Animator позволяет также экспортировать часть кадров анимации с созданием нового анимированного GIF-файла либо группы отдельных GIF-файлов, содержащих по одному кадру. Для этого выбирают команду File > Export Image Layers (Файл > Экспорт кадров), открывающую окно Export Images (Экспорт кадров), в котором выделяют экспортируемые кадры (Рисунок 1.13).